山东中医药大学实验中心成立于2011年3月，由原隶属于教务处的教学实验中心和隶属于科技处的科研实验中心整合而成。实验中心教学、科研实验室面积达7.58万平方米，其中科研实验室面积2.26万平方，药用植物园建设36亩，入库资产3.64亿元。

实验中心为学校实验教学和科学研究提供服务。负责实验教学示范中心和科研公共服务平台（医学科研公共服务平台、药学科研公共服务平台、实验动物中心、抗病毒中心、校企联合实验室及其他功能性科研公共服务平台）运行管理及校内外开放共享服务。并按要求开展中医师岗位胜任力第二阶梯考核、临床医学专业（本科）水平测试、国家执业医师资格考试等医学技能类考试、山东省师承考试、山东省确有专长等各类考试及校内外临床技能比赛的相关考务、考站等工作。

实验中心立足学校发展需要，通过优化整合资源，支撑学校高层次人才培养和科技创新。