2019年12月,湖北省武汉市出现不明原因肺炎疫情,随后证实其是由新型冠状病毒(SARS-CoV-2)引起的。截止到目前,该病毒对国家的公共安全和人民群众健康带来严重的危害。防控SARS-CoV-2感染的肺炎疫情是当前最重要的工作,疫情就是命令,防控就是责任。近2个月来,山东中医药大学的中医药抗病毒协同创新中心在学校领导指挥下,组织科研力量,积极主动出击,发挥多学科交叉、平台资源共享、团队协作的优势,紧密追踪SARS-CoV-2最新研究进展,夜以继日开展科学研究,不断夯实研究假设,力图在传统中药中寻找有效成分和组分。课题组研究人员基于中药系统药理学数据库和分析平台TCMSP,以SARS-CoV-2 3CL水解酶蛋白为靶点,利用Autodock Vina软件和Python脚本实现高通量分子对接,结合“ADME-Lipinski”规则进行再次筛选,获得66个药代动力学性质良好的天然小分子抑制剂,优选出11味中药单味药,2个中药药对甘草-桑白皮和金银花-连翘,以及桑菊饮、桑菊饮合银翘散加减等12个中药处方作为抗击新型冠状病毒的候选方案。本研究基于高通量分子对接技术虚拟筛选SARS-CoV-2 3CL水解酶的中药小分子抑制剂及中药,结合网络药理学分析潜在分子机制,为中药抗击新型冠状病毒提供了科学指导与理论依据。
以上研究工作发表在2020年03月05日《中草药》网络版,文章链接:
http://kns.cnki.net/kcms/detail/12.1108.R.20200305.1441.004.html
图1 SARS-CoV-23CL水解酶与原配体的二维及三维分子对接模式
图2 SARS-CoV-23CL水解酶与南荛素(a、b)、穗花双黄酮(c、d)和bisindigotin(e、f)的二维及三维分子对接模式
图3 甘草-桑白皮药对的GO富集分析
图4 甘草-桑白皮药对潜在靶点KEGG通路富集分析的10条通路
图5 “甘草-桑白皮”药对成分-靶点-通路网络